Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D5Q8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms