Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc105Q9D4K7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms