Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931423N10RikQ9D4J9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms