Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhd1Q9D4J1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms