Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D3J9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D3J9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D3J9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D3J9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D3J9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D3J9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms