Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms