Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrto4Q9D0I8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrto4Q9D0I8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms