Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx17Q9D0I4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx17Q9D0I4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms