Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms