Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx28Q9CWT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms