Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gadd45gip1Q9CR59 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gadd45gip1Q9CR59 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gadd45gip1Q9CR59 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms