Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid1ip1Q9CQ20 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms