Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx30Q99PU8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx30Q99PU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx30Q99PU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dhx30Q99PU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dhx30Q99PU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dhx30Q99PU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dhx30Q99PU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms