Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim3Q99PE5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms