Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsnaxip1Q99P25 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms