Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms