Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6bQ99N09 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 587.9 ms