Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gps1Q99LD4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms