Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Alpk3Q924C5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Alpk3Q924C5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms