Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdl1Q923A2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdl1Q923A2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms