Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx41Q91VN6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx41Q91VN6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms