Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk4Q8VEJ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms