Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg8Q8VE18 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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