Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3il1Q8VDV3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3il1Q8VDV3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms