Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20bQ8VCS3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms