Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpap2Q8VC34 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpap2Q8VC34 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 324.3 ms