Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d23Q8K0F1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d23Q8K0F1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d23Q8K0F1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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