Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Card11Q8CIS0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Card11Q8CIS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms