Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp1Q8C8U0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms