Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc93Q7TQK5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms