Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf139Q7TMV1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf139Q7TMV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms