Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rtl1Q7M732 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rtl1Q7M732 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rtl1Q7M732 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rtl1Q7M732 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rtl1Q7M732 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rtl1Q7M732 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Rtl1Q7M732 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rtl1Q7M732 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rtl1Q7M732 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rtl1Q7M732 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rtl1Q7M732 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rtl1Q7M732 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rtl1Q7M732 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rtl1Q7M732 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rtl1Q7M732 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms