Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms