Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms