Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med16Q6PGF3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med16Q6PGF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med16Q6PGF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms