Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I2

BC061237, MCG114023, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061237Q6P8I2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061237Q6P8I2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061237Q6P8I2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms