Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NesQ6P5H2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms