Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Szrd1Q6NXN1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.7 ms