Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ggnbp1Q6K1E7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms