Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx11Q6AXC6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms