Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp9cQ66X01 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms