Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clcn1Q64347 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 781.4 ms