Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtafrQ62035 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtafrQ62035 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms