Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms