Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mkrn3Q60764 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms