Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P4ha1Q60715 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha1Q60715 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha1Q60715 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha1Q60715 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha1Q60715 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha1Q60715 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha1Q60715 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha1Q60715 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms