Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc27a1Q60714 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a1Q60714 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a1Q60714 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms