Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms