Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
9930111J21Rik1Q5SVP0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms