Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms