Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms